Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rad23aP54726 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rad23aP54726 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms