Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efnb1P52795 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms