Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl5P50228 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl5P50228 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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