Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Hoxc13P50207 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Hoxc13P50207 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxc13P50207 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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