Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GdnfP48540 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GdnfP48540 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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GdnfP48540 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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GdnfP48540 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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GdnfP48540 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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GdnfP48540 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
GdnfP48540 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
GdnfP48540 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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