Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rplp1P47955 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms