Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rab11bP46638 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab11bP46638 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms