Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtgfrP43117 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms