Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Timp3P39876 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms