Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Hoxc11P31313 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms