Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa10P31310 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms