Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VtnP29788 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VtnP29788 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms