Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprmP28828 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtprmP28828 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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