Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PdgfraP26618 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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