Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RarbP22605 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RarbP22605 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RarbP22605 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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