Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18525 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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P18525 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18525 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P18525 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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