Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sptan1P16546 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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