Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms