Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P01649 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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P01649 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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P01649 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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P01649 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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P01649 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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P01649 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
P01649 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P01649 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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