Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Stra6O70491 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Stra6O70491 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms