Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfi1bO70237 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms