Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Foxq1O70220 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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