Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ptpn20O55082 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms