Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DffaO54786 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DffaO54786 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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DffaO54786 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DffaO54786 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DffaO54786 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms