Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Opn1mwO35599 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Opn1mwO35599 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms