Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Prrt1O35449 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prrt1O35449 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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