Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Foxd2O35392 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxd2O35392 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms