Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smad6O35182 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms