Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Casq1O09165 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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