Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5225J3QPL3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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