Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5849J3QPE5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms