Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms