Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Taf4bG5E8Z2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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