Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G3

Opcml, MCG9827, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpcmlG5E8G3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
OpcmlG5E8G3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms