Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r58G3X9U3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms