Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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Usp9yF8VPU6 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
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Usp9yF8VPU6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Usp9yF8VPU6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Usp9yF8VPU6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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