Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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H2-M1F7CXU4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H2-M1F7CXU4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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