Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm28048F7BCN0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm28048F7BCN0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm28048F7BCN0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm28048F7BCN0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm28048F7BCN0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm28048F7BCN0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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