Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc1E9Q043 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms