Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx60E9PZQ1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ddx60E9PZQ1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ddx60E9PZQ1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ddx60E9PZQ1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ddx60E9PZQ1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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