Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc8E9PWG2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc8E9PWG2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms