Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms