Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samd1D3YXK1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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