Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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