Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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