Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prrt4B2RU40 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms