Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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