Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Gm6880A3KG45 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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