Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
AgrnA2ASQ1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms