Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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